Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 RPL9P15-201ENST00000491096 532 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 AL138974.1-201ENST00000551227 741 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 AL589765.6-201ENST00000601909 549 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 AL596275.2-207ENST00000641188 675 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PPARGC1AQ9UBK2 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
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