Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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SAMD8Q96LT4 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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SAMD8Q96LT4 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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SAMD8Q96LT4 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
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SAMD8Q96LT4 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
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SAMD8Q96LT4 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
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