Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 ARL14EPL-201ENST00000601302 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 HCFC2P1-201ENST00000392864 1592 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AP001610.2-201ENST00000415820 422 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AC127526.3-201ENST00000534291 450 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 CASC22-202ENST00000628396 802 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 LINC01720-201ENST00000413356 2216 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 MTCO1P8-201ENST00000416914 1523 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 MEF2C-244ENST00000636998 5936 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
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