Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 OR2H1-204ENST00000396792 1294 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 PDCL3P5-201ENST00000398028 722 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 TIMD4-203ENST00000407087 1145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 RN7SKP137-201ENST00000411074 307 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 RPS7P12-201ENST00000422385 582 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 FDPSP6-201ENST00000425091 512 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 ETDA-201ENST00000427686 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC096677.2-201ENST00000430471 598 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC068888.2-201ENST00000435621 536 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 NFIA-AS2-203ENST00000438559 1275 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AL353803.3-201ENST00000444641 335 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 LINC01105-205ENST00000450794 580 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 LINC01364-201ENST00000452509 889 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 RN7SL654P-201ENST00000479178 292 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 CFI-204ENST00000510800 667 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 LINC02055-203ENST00000520068 712 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC011410.1-201ENST00000524175 705 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC107952.1-201ENST00000524200 376 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 PCED1B-AS1-202ENST00000547600 523 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 RN7SL270P-201ENST00000579643 281 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC018521.2-202ENST00000582142 473 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC011120.1-201ENST00000583916 624 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 Metazoa_SRP.202-201ENST00000585071 281 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 ZNF675-204ENST00000599168 592 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 CLK4-214ENST00000611575 1206 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 GBA3-207ENST00000613293 1233 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 MKI67P1-201ENST00000604297 1460 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 EEF1A1P16-201ENST00000325349 1414 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 ENSA-207ENST00000362052 703 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 NOX1-203ENST00000372964 661 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 TRAV22-201ENST00000390450 464 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 RNA5SP474-201ENST00000391234 90 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC024937.2-201ENST00000411669 1242 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AL359633.1-201ENST00000421403 310 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms