Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 GMDS-AS1-202ENST00000505870 8217 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 LPP-208ENST00000448637 5835 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 ETV1-201ENST00000242066 6348 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 LINC01128-205ENST00000445118 6606 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 SCN9A-202ENST00000409435 5967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 AC016251.2-201ENST00000623393 3089 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 NOSTRIN-202ENST00000397206 1446 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 LINC02218-202ENST00000504998 582 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 IL16-204ENST00000394660 9616 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 VCAN-202ENST00000342785 7154 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 AK3-201ENST00000359883 1536 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 NSUN4-208ENST00000498008 3867 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 ZHX3-201ENST00000309060 10030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
COL24A1Q17RW2 ITPR1-202ENST00000354582 10242 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 NIPBL-202ENST00000448238 8729 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 ZNF365-204ENST00000395251 2695 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 TACC1-210ENST00000520615 5509 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
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