Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 WBP1LP12-201ENST00000604449 331 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
USF2Q15853 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 LINC01058-201ENST00000420694 448 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AL158835.1-204ENST00000449693 371 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC078785.2-201ENST00000462010 1253 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 GUSBP9-201ENST00000510138 584 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 HMGN1P17-201ENST00000513734 295 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 NAV2-IT1-201ENST00000528204 506 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC023905.1-201ENST00000559799 1178 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC138207.8-204ENST00000579588 527 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AJ009632.2-205ENST00000635225 1169 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USF2Q15853 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.5 ms