Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC106774.2-201ENST00000510266 406 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC092336.1-201ENST00000510562 415 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 EIF3KP1-201ENST00000513279 656 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 RNA5SP422-201ENST00000516778 111 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AL135934.1-201ENST00000527684 537 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AP006437.1-202ENST00000530327 933 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 TPRXL-210ENST00000532753 478 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 WBP2NL-210ENST00000543212 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC010809.1-201ENST00000560268 562 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC124283.2-201ENST00000575085 318 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC023421.2-202ENST00000586213 547 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AL513321.2-202ENST00000634479 921 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 TCF12-205ENST00000537840 1598 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 LINC01505-203ENST00000435485 1686 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 LINC01194-202ENST00000505877 1319 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 RBPJP6-201ENST00000411556 1431 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 OR2M4-201ENST00000306687 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 HHLA3-203ENST00000370940 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 OR1N2-201ENST00000373688 1103 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 TRAV38-1-201ENST00000390464 353 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 DNASE1L3-201ENST00000394549 1294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 OR2H1-204ENST00000396792 1294 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 RSPH14-202ENST00000406876 519 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
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VAMP3Q15836 AL590729.1-201ENST00000427046 573 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
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VAMP3Q15836 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 PRELID1P3-201ENST00000450055 643 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
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VAMP3Q15836 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
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VAMP3Q15836 AP001831.1-201ENST00000524610 411 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
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VAMP3Q15836 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 NPM1P45-201ENST00000583151 559 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC006116.6-201ENST00000593258 1103 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AL139123.1-201ENST00000612008 430 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 uc_338.33-201ENST00000614988 170 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 MIR6749-201ENST00000617008 69 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
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