Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 LINC01780-202ENST00000457683 391 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.2 ms