Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 C11orf1-203ENST00000529270 1437 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 NR1H5P-201ENST00000452683 1377 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 SEPT7P2-202ENST00000398921 823 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 OOSP1-201ENST00000398992 1270 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 ANAPC10-213ENST00000512680 505 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 AC021483.1-201ENST00000560760 539 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 CNEP1R1-204ENST00000562576 656 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
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SS18Q15532 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 MS4A3-201ENST00000278865 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
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SS18Q15532 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
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SS18Q15532 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SS18Q15532 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
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SS18Q15532 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SS18Q15532 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SS18Q15532 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SS18Q15532 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SS18Q15532 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SS18Q15532 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SS18Q15532 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SS18Q15532 AP001610.2-201ENST00000415820 422 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SS18Q15532 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SS18Q15532 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SS18Q15532 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SS18Q15532 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SS18Q15532 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SS18Q15532 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SS18Q15532 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SS18Q15532 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SS18Q15532 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SS18Q15532 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SS18Q15532 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SS18Q15532 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SS18Q15532 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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