Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 LINC01013-205ENST00000458028 1345 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 CXADRP1-201ENST00000398098 1095 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 LINC01363-202ENST00000428030 930 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 CXADRP3-202ENST00000617265 1100 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
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