Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 ENTPD1-205ENST00000453258 5044 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 OR5A2-201ENST00000302040 6318 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 ZNF969P-201ENST00000510345 2341 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 PCDH15-231ENST00000617271 6425 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 ZNF521-203ENST00000538137 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 CDYL2-207ENST00000570137 8159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 CR1-205ENST00000367053 7469 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 ITSN1-206ENST00000381318 17015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 MROH9-201ENST00000367758 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 KMT2A-213ENST00000534358 16602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 AL034408.1-201ENST00000637712 664 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 ZNF639-201ENST00000326361 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 NBPF8-201ENST00000583271 5330 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms