Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC8.93□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC8.92□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC8.92□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC8.92□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC8.92□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC8.92□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC8.91□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC8.91□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC8.91□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC8.91□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC8.91□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
NEUROD1Q13562 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms