Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 CYP2C8-201ENST00000371270 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.6 ms