Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC8.1□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC8.1□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC8.1□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.1□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
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TCOF1Q13428 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC8.09□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
TCOF1Q13428 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 INTS2-207ENST00000617492 5805 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
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TCOF1Q13428 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 CTNND1-231ENST00000532463 5749 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
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TCOF1Q13428 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC8.08□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 SIAH3-201ENST00000400405 7057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
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TCOF1Q13428 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 IGSF6-201ENST00000268389 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC8.07□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
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