Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF1Q12946 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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