Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 AK3-201ENST00000359883 1536 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 MGST1-205ENST00000396210 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FAM3AP98173 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.6 ms