Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AC107977.1-201ENST00000355745 939 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 CAPSL-201ENST00000397366 969 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
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PGGT1BP53609 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
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PGGT1BP53609 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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PGGT1BP53609 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
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PGGT1BP53609 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
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PGGT1BP53609 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
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PGGT1BP53609 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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PGGT1BP53609 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AC079075.2-201ENST00000557964 449 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AC018767.2-201ENST00000562361 600 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
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