Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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ARL2-SNX15V9GYD0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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ARL2-SNX15V9GYD0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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ARL2-SNX15V9GYD0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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ARL2-SNX15V9GYD0 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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ARL2-SNX15V9GYD0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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ARL2-SNX15V9GYD0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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ARL2-SNX15V9GYD0 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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ARL2-SNX15V9GYD0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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ARL2-SNX15V9GYD0 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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