Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC61Q9Y6R9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms