Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GTF3C3Q9Y5Q9 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF3C3Q9Y5Q9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms