Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LEMD3Q9Y2U8 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LEMD3Q9Y2U8 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LEMD3Q9Y2U8 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LEMD3Q9Y2U8 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LEMD3Q9Y2U8 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LEMD3Q9Y2U8 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LEMD3Q9Y2U8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LEMD3Q9Y2U8 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LEMD3Q9Y2U8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LEMD3Q9Y2U8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LEMD3Q9Y2U8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LEMD3Q9Y2U8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LEMD3Q9Y2U8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LEMD3Q9Y2U8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LEMD3Q9Y2U8 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LEMD3Q9Y2U8 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LEMD3Q9Y2U8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LEMD3Q9Y2U8 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LEMD3Q9Y2U8 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LEMD3Q9Y2U8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LEMD3Q9Y2U8 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LEMD3Q9Y2U8 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LEMD3Q9Y2U8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LEMD3Q9Y2U8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LEMD3Q9Y2U8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LEMD3Q9Y2U8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LEMD3Q9Y2U8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LEMD3Q9Y2U8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LEMD3Q9Y2U8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LEMD3Q9Y2U8 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LEMD3Q9Y2U8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LEMD3Q9Y2U8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LEMD3Q9Y2U8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms