Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GGA1Q9UJY5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GGA1Q9UJY5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms