Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SCN11AQ9UI33 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms