Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
IFT172Q9UG01 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IFT172Q9UG01 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms