Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL13Q9P2N7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms