Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RRBP1Q9P2E9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RRBP1Q9P2E9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 214.2 ms