Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2A4

ABI3, ABI gene family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABI3Q9P2A4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABI3Q9P2A4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ABI3Q9P2A4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms