Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUD5

ZCCHC3, Zinc finger CCHC domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZCCHC3Q9NUD5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms