Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
DUOX1Q9NRD9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUOX1Q9NRD9 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms