Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA1

KCNMB3, Calcium-activated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB3Q9NPA1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNMB3Q9NPA1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCNMB3Q9NPA1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCNMB3Q9NPA1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNMB3Q9NPA1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNMB3Q9NPA1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNMB3Q9NPA1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNMB3Q9NPA1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNMB3Q9NPA1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNMB3Q9NPA1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNMB3Q9NPA1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNMB3Q9NPA1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNMB3Q9NPA1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNMB3Q9NPA1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNMB3Q9NPA1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNMB3Q9NPA1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNMB3Q9NPA1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNMB3Q9NPA1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNMB3Q9NPA1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNMB3Q9NPA1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNMB3Q9NPA1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNMB3Q9NPA1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNMB3Q9NPA1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNMB3Q9NPA1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNMB3Q9NPA1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNMB3Q9NPA1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNMB3Q9NPA1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNMB3Q9NPA1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNMB3Q9NPA1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNMB3Q9NPA1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNMB3Q9NPA1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNMB3Q9NPA1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNMB3Q9NPA1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNMB3Q9NPA1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNMB3Q9NPA1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNMB3Q9NPA1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNMB3Q9NPA1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNMB3Q9NPA1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNMB3Q9NPA1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNMB3Q9NPA1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNMB3Q9NPA1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNMB3Q9NPA1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNMB3Q9NPA1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNMB3Q9NPA1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNMB3Q9NPA1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNMB3Q9NPA1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNMB3Q9NPA1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNMB3Q9NPA1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNMB3Q9NPA1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNMB3Q9NPA1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNMB3Q9NPA1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNMB3Q9NPA1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNMB3Q9NPA1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNMB3Q9NPA1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNMB3Q9NPA1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNMB3Q9NPA1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNMB3Q9NPA1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNMB3Q9NPA1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNMB3Q9NPA1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms