Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM27Q9HBJ8 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM27Q9HBJ8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM27Q9HBJ8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM27Q9HBJ8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM27Q9HBJ8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM27Q9HBJ8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM27Q9HBJ8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM27Q9HBJ8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM27Q9HBJ8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM27Q9HBJ8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM27Q9HBJ8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM27Q9HBJ8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM27Q9HBJ8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM27Q9HBJ8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM27Q9HBJ8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM27Q9HBJ8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM27Q9HBJ8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM27Q9HBJ8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM27Q9HBJ8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM27Q9HBJ8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM27Q9HBJ8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM27Q9HBJ8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM27Q9HBJ8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM27Q9HBJ8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM27Q9HBJ8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM27Q9HBJ8 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM27Q9HBJ8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM27Q9HBJ8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM27Q9HBJ8 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM27Q9HBJ8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM27Q9HBJ8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM27Q9HBJ8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM27Q9HBJ8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM27Q9HBJ8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM27Q9HBJ8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM27Q9HBJ8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM27Q9HBJ8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM27Q9HBJ8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM27Q9HBJ8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM27Q9HBJ8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM27Q9HBJ8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM27Q9HBJ8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM27Q9HBJ8 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM27Q9HBJ8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM27Q9HBJ8 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM27Q9HBJ8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM27Q9HBJ8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM27Q9HBJ8 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM27Q9HBJ8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM27Q9HBJ8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM27Q9HBJ8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM27Q9HBJ8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM27Q9HBJ8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM27Q9HBJ8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM27Q9HBJ8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM27Q9HBJ8 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM27Q9HBJ8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM27Q9HBJ8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM27Q9HBJ8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM27Q9HBJ8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM27Q9HBJ8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM27Q9HBJ8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM27Q9HBJ8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM27Q9HBJ8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM27Q9HBJ8 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM27Q9HBJ8 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM27Q9HBJ8 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM27Q9HBJ8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM27Q9HBJ8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM27Q9HBJ8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM27Q9HBJ8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM27Q9HBJ8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM27Q9HBJ8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM27Q9HBJ8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM27Q9HBJ8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM27Q9HBJ8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM27Q9HBJ8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM27Q9HBJ8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM27Q9HBJ8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM27Q9HBJ8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM27Q9HBJ8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM27Q9HBJ8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM27Q9HBJ8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM27Q9HBJ8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM27Q9HBJ8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM27Q9HBJ8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM27Q9HBJ8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM27Q9HBJ8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM27Q9HBJ8 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM27Q9HBJ8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM27Q9HBJ8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM27Q9HBJ8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM27Q9HBJ8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM27Q9HBJ8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM27Q9HBJ8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM27Q9HBJ8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TMEM27Q9HBJ8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM27Q9HBJ8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM27Q9HBJ8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms