Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCAS3Q9H6U6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms