Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 AC131182.1-201ENST00000509184 657 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 AC007494.2-201ENST00000563757 764 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 RPS3AP29-201ENST00000437728 769 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 MTND2P12-201ENST00000417560 1252 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 AC005534.1-201ENST00000455709 742 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 AC137794.1-201ENST00000509185 914 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 LINC02207-201ENST00000554530 1256 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 HIST2H4B-201ENST00000579512 1132 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 AL109924.4-201ENST00000623089 670 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 AC123767.1-204ENST00000523523 273 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 AC007041.1-201ENST00000438989 1155 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 AP005597.1-201ENST00000534192 802 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 AC068408.1-201ENST00000577406 1144 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms