Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRRCC1Q9C099 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRCC1Q9C099 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms