Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFIH1Q9BYX4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
IFIH1Q9BYX4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
IFIH1Q9BYX4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
IFIH1Q9BYX4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
IFIH1Q9BYX4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFIH1Q9BYX4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFIH1Q9BYX4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFIH1Q9BYX4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFIH1Q9BYX4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFIH1Q9BYX4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFIH1Q9BYX4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFIH1Q9BYX4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFIH1Q9BYX4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFIH1Q9BYX4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFIH1Q9BYX4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFIH1Q9BYX4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFIH1Q9BYX4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFIH1Q9BYX4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFIH1Q9BYX4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFIH1Q9BYX4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
IFIH1Q9BYX4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFIH1Q9BYX4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFIH1Q9BYX4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFIH1Q9BYX4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFIH1Q9BYX4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFIH1Q9BYX4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
IFIH1Q9BYX4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFIH1Q9BYX4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFIH1Q9BYX4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFIH1Q9BYX4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFIH1Q9BYX4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
IFIH1Q9BYX4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFIH1Q9BYX4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFIH1Q9BYX4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFIH1Q9BYX4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFIH1Q9BYX4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFIH1Q9BYX4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFIH1Q9BYX4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IFIH1Q9BYX4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IFIH1Q9BYX4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFIH1Q9BYX4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IFIH1Q9BYX4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFIH1Q9BYX4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IFIH1Q9BYX4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFIH1Q9BYX4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFIH1Q9BYX4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFIH1Q9BYX4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms