Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms