Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms