Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RBM42Q9BTD8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms