Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGIP1Q9BQI5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms