Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYD88Q99836 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms