Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
EYA3Q99504 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
EYA3Q99504 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms