Protein–RNA interactions for Protein: Q99496

RNF2, E3 ubiquitin-protein ligase RING2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF2Q99496 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF2Q99496 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF2Q99496 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF2Q99496 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF2Q99496 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF2Q99496 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF2Q99496 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF2Q99496 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF2Q99496 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF2Q99496 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF2Q99496 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF2Q99496 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF2Q99496 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF2Q99496 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF2Q99496 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF2Q99496 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF2Q99496 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF2Q99496 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms