Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms