Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ARXQ96QS3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms