Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAPPC9Q96Q05 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms