Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC7Q96NW7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC7Q96NW7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms