Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN8

NEURL4, Neuralized-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL4Q96JN8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEURL4Q96JN8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEURL4Q96JN8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NEURL4Q96JN8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NEURL4Q96JN8 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEURL4Q96JN8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEURL4Q96JN8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEURL4Q96JN8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEURL4Q96JN8 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEURL4Q96JN8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEURL4Q96JN8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEURL4Q96JN8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEURL4Q96JN8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEURL4Q96JN8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEURL4Q96JN8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEURL4Q96JN8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEURL4Q96JN8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEURL4Q96JN8 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEURL4Q96JN8 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEURL4Q96JN8 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NEURL4Q96JN8 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NEURL4Q96JN8 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEURL4Q96JN8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEURL4Q96JN8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEURL4Q96JN8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEURL4Q96JN8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEURL4Q96JN8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEURL4Q96JN8 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEURL4Q96JN8 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NEURL4Q96JN8 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NEURL4Q96JN8 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
NEURL4Q96JN8 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NEURL4Q96JN8 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NEURL4Q96JN8 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NEURL4Q96JN8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NEURL4Q96JN8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NEURL4Q96JN8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NEURL4Q96JN8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NEURL4Q96JN8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms