Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB6

LOXL4, Lysyl oxidase homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL4Q96JB6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
LOXL4Q96JB6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LOXL4Q96JB6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LOXL4Q96JB6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LOXL4Q96JB6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LOXL4Q96JB6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LOXL4Q96JB6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LOXL4Q96JB6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LOXL4Q96JB6 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LOXL4Q96JB6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LOXL4Q96JB6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LOXL4Q96JB6 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LOXL4Q96JB6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LOXL4Q96JB6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LOXL4Q96JB6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LOXL4Q96JB6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LOXL4Q96JB6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LOXL4Q96JB6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LOXL4Q96JB6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms