Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED3Q96IU2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 235.7 ms