Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LTV1Q96GA3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms